A sziget az évszázadok folyamán több ország fennhatósága alá került. A XVI. században a portugál felfedező, Tristao da Cunha gyarmatosította Suq városát, ahol számos épület őrzi a hét éves idegen uralom nyomát. 1511-ben Mahra szultánjai kormányozták a szigetet, 1866-ban pedig Socotra brit protektorátus lett. Kedvező fekvésének köszönhetően fontos szerepet kapott a Nagy-Britanniába vezető tengeri kereskedelmi útvonalon. A sziget 1969 óta közigazgatásilag Jemenhez tartozik és igazán csak 1999 óta vonz turistákat, hiszen akkor nyílt meg a repülőtere.